famexploreR

flujo de trabajo para gestión de
datos de Flora Amenazada de Andalucía

Antonio J. Pérez-Luque

Instituto de Ciencias Forestales (ICIFOR), INIA-CSIC

Juan Lorite

Dpto. Botánica, Universidad de Granada

November 25, 2024

Propuesta

  1. Disminuir complejidad manejo datos
    1. Disminuir manipulación datos
    2. Similitud estadillo campo - BBDD
  2. Aumentar eficiencia Entrada/Salida Datos
  3. Generación Informes de seguimiento de forma sencilla
  4. Integración con otras bases de datos
  5. Análisis avanzados

Flujo Trabajo

  1. Introducción datos en hojas de cálculo

    1. estandarización nombres archivos
  2. Automatizar lectura de datos

  3. Generar informes de seguimiento sencillos

Entrada de datos

Efecto del vallado sobre Potencial reproductivo, tamaño individual y vecindad

25-30 ind. al azar/población (vallado / no vallado)

  • Potencial reproductivo: número de flores, frutos y semillas
  • Tamaño individual: altura, diámetro, biovolumen
  • Vecindad:
    • distancia a individuos más cercanos (Nearest Neighbour)
    • densidad por especie

Efecto del vallado sobre la estructura, composición taxonómica y funcional de la comunidad vegetal

  • Composición de la comunidad (identidad/abundancia relativa):
    • composición y cobertura (%) dentro/fuera de vallado
    • 3 transectos (10-25m x 2m; 3 ptos.contacto/50 cm)
  • Densidad de la especie focal
  • Estructura y composición funcional:
    • grupos funcionales (herbácea, árbol o arbusto) y clases demográficas (plántula, juvenil y adulto)

Estimación del daño por herbivoría

Porcentaje de defoliación en escala semicuantitativa (10 individuos por población, 5 hojas por individuo).

Densidad ungulados

  • Conteo de excrementos: Total excrementos/superficie de 100 m2 en torno a los transecto

Estadillo de campo (digital)

  • Simple
  • Fácil manejo
  • Similar a estadillo físico

Estadillo digital

Estadillo de campo (digital) (II)

  • Estructura
    • Metadatos
    • Datos
    • Diccionarios

Estadillo de campo (digital) (III)

  • Metadatos
    • Introducción datos generales
    • Diccionarios: taxones, tratamintos
    • Importancia de rellenar bien los metadatos

Estadillo de campo (digital) (IV)

  • Datos
    • Metadatos heredados
    • Autorrellado de metadatos

Estadillo de campo (digital) (V)

  • Diccionarios
    • Modificación por administradores

live-app

Generación Informes

Siguientes (primeros) pasos

Evaluar funcionamiento con técnicos de seguimiento

  • Tests con más datos reales, más usuarios
  • Feedback para mejorar la interfaz y funcionalidades
  • Solucionar errores y bugs

Documentación y mejora del paquete y de la app


Desarrollo de nuevas funcionalidades

Implementación de análisis avanzados

Integración con otras bases de datos (e.g. GBIF)

Muchas gracias por la atención

Ayuda JDC2022-050056-I financiada por MCIN/AEI /10.13039/501100011033 y por la Unión Europea NextGenerationEU/PRTR